| 事業者名 | 線名 | 区間 | 備考 |
| 北海道旅客鉄道 | 海峡線 | 新中小国（信）〜木古内 | 新幹線と共用 |
| 札沼線 | 八軒〜あいの里教育大 | ||
| 宗谷線 | 旭川〜北旭川 | ||
| 千歳線 | 沼ノ端〜白石(〜札幌) | ||
| 函館線 | 函館〜七飯 | ||
| 森〜鷲ノ巣 | |||
| 山崎〜黒岩 | |||
| 北豊津〜長万部 | |||
| 小樽〜旭川 | |||
| 室蘭線 | 長万部〜洞爺 | ||
| 有珠〜長和 | |||
| 稀府〜三川 | |||
| 由仁〜栗山 | |||
| 東室蘭〜室蘭 | |||
| 北海道新幹線 | 新青森〜新函館北斗 | 新中小国(信)〜木古内 在来線と共用 | |
| 東日本旅客鉄道 | 赤羽線 | 池袋〜赤羽 | |
| 伊東線 | 熱海〜来宮 | ||
| 羽越線 | 新発田〜金塚 | ||
| 中条〜平林 | |||
| 村上〜間島 | |||
| 越後早川〜桑川 | |||
| 越後寒川〜勝木 | |||
| 府屋〜小岩川 | |||
| あつみ温泉〜羽前大山 | |||
| 藤島〜本楯 | |||
| 遊佐〜吹浦 | |||
| 金浦〜仁賀保 | |||
| 西目〜折渡 | |||
| 道川〜下浜 | |||
| 内房線 | 蘇我〜君津 | ||
| 越後線 | 上所〜新潟 | ||
| 奥羽線 | 福島〜関根 | ||
| 赤湯〜北赤湯(信) | |||
| 羽前中山〜山形 | |||
| 芦沢〜舟形 | |||
| 及位〜院内 | |||
| 神宮寺〜峰吉川 | |||
| 秋田〜追分 | |||
| 羽後飯塚〜八郎潟 | |||
| 鹿渡〜森岳 | |||
| 鶴形〜前山 | |||
| 鷹巣〜早口 | |||
| 大館〜長峰 | |||
| 石川〜川部 | |||
| 青梅線 | 立川〜東青梅 | ||
| 川越線 | 大宮〜日進 | ||
| 京葉線 | 西船橋〜蘇我 | ||
| 東京〜南船橋 | |||
| 市川塩浜〜西船橋 | |||
| 篠ノ井線 | 明科〜田沢 | ||
| 松本〜塩尻 | |||
| 上越線 | 高崎〜宮内 | ||
| 越後湯沢〜ガーラ湯沢 | |||
| 常磐線 | （上野〜）日暮里〜四ツ倉 | ||
| （綾瀬〜取手） | |||
| 三河島〜田端(信) | |||
| 広野〜木戸 | |||
| 信越線 | 高崎〜横川 | ||
| 篠ノ井〜長野 | |||
| 直江津〜新潟 | |||
| 越後石山〜新潟貨物ターミナル | |||
| 仙石線 | あおば通〜東塩釜 | ||
| 総武線 | 東京〜佐倉 | ||
| （千葉〜）錦糸町〜御茶ノ水 | |||
| 外房線 | 千葉〜上総一ノ宮 | ||
| 東浪見〜長者町 | |||
| 御宿〜勝浦 | |||
| 高崎線 | 大宮〜高崎 | ||
| 中央線 | 東京〜普門寺(信) | ||
| （御茶ノ水〜三鷹） | |||
| 岡谷〜塩尻 | |||
| 鶴見線 | 鶴見〜浜川崎 | ||
| 浅野〜新芝浦 | |||
| 東海道線 | 東京〜熱海 | ||
| (東京〜横浜)(京浜東北線) | |||
| (東京〜品川)(山手線) | |||
| (東京〜)品川〜新川崎〜鶴見(〜大船)（横須賀線） | |||
| 東京貨物ﾀｰﾐﾅﾙ〜浜川崎 | |||
| (川崎新町〜)八丁畷〜鶴見 | |||
| 鶴見〜横浜羽沢〜東戸塚(〜小田原) | |||
| 鶴見〜東高島 | |||
| 東北線 | (東京〜)日暮里〜尾久〜盛岡 | ||
| (田端(信)〜大宮) | |||
| (東京〜田端)(山手線) | |||
| 東京〜赤羽(〜大宮)(京浜東北線) | |||
| 赤羽〜武蔵浦和〜大宮（埼京線) | |||
| (上野〜尾久)(回送線) | |||
| 長町〜東仙台 | |||
| 成田線 | 佐倉〜成田 | ||
| 南武線 | 川崎〜立川 | ||
| 川崎新町〜浜川崎 | |||
| 根岸線 | 横浜〜大船 | ||
| 白新線 | 新潟〜新崎 | ||
| 武蔵野線 | 鶴見〜西船橋 | ||
| 西浦和〜大宮(操) | |||
| (武蔵浦和〜別所(信)) | |||
| 南流山〜北小金 | 日本貨物鉄道第２種鉄道 | ||
| 山手線 | 品川〜田端 | ||
| (大崎〜田端(信)) | |||
| 横須賀線 | 大船〜横須賀 | ||
| 横浜線 | 東神奈川〜八王子 | ||
| 両毛線 | 岩舟〜佐野 | ||
| 駒形〜前橋 | |||
| 東北新幹線 | 東京〜新青森 | ||
| 上越新幹線 | 大宮〜新潟 | ||
| 北陸新幹線 | 高崎〜上越妙高 | ||
| 東海旅客鉄道 | 飯田線 | 豊橋〜豊川 | |
| 関西線 | 名古屋〜笹島(信) | ||
| 弥富〜桑名 | |||
| 朝明(信)〜富田 | |||
| 富田浜〜四日市 | |||
| 南四日市〜河原田 | |||
| 中央線 | 塩尻〜贄川 | ||
| 奈良井〜宮ノ越 | |||
| 原野〜倉本 | |||
| 十二兼〜名古屋 | |||
| 東海道線 | 熱海〜米原 | ||
| (名古屋〜稲沢) | |||
| 身延線 | 富士〜富士宮 | ||
| 東海道新幹線 | 東京〜新大阪 | ||
| 西日本旅客鉄道 | 宇野線 | 早島〜久々原 | |
| 大阪環状線 | 天王寺〜新今宮（〜天王寺） | ||
| 片町線 | 松井山手〜京橋 | ||
| 関西線 | 木津〜ＪＲ難波 | ||
| 紀勢線 | 紀伊田辺〜和歌山 | ||
| 湖西線 | 近江塩津〜山科 | ||
| 桜島線 | 西九条〜桜島 | 西九条〜ﾕﾆﾊﾞｰｻﾙｼﾃｨ 単線並列 | |
| 山陰線 | 京都〜園部 | ||
| 綾部〜福知山 | |||
| 伯耆大山〜安来 | |||
| 東松江〜松江 | |||
| 玉造温泉〜来待 | |||
| 山陽線 | 神戸〜下関 | ||
| （神戸〜西明石） | |||
| （海田市〜広島） | |||
| 東海道線 | 米原〜神戸 | ||
| （草津〜神戸） | |||
| 吹田貨物ターミナル〜尼崎 | |||
| (茨木〜)吹田貨物ターミナル〜大阪 | 日本貨物鉄道第２種鉄道 | ||
| 奈良線 | 京都〜城陽 | ||
| 山城多賀〜玉水 | |||
| 伯備線 | 倉敷〜備中高梁 | ||
| 井倉〜石蟹 | |||
| 阪和線 | 天王寺〜和歌山 | ||
| 福知山線 | 尼崎〜篠山口 | ||
| 北陸線 | 米原〜敦賀 | ||
| 本四備讃線 | 茶屋町〜児島 | ||
| 山陽新幹線 | 新大阪〜博多 | ||
| 北陸新幹線 | 上越妙高〜敦賀 | ||
| 博多南線 | 博多〜博多南 | ||
| 西日本旅客鉄道(第２種鉄道) 関西高速鉄道(第３種鉄道) |
ＪＲ東西線 | 京橋〜尼崎 | |
| 西日本旅客鉄道(第２種鉄道) 大阪外環状鉄道(第３種鉄道) |
おおさか東線 | 新大阪〜久宝寺 | |
| 四国旅客鉄道 | 予讃線 | 高松〜多度津 | |
| 本四備讃線 | 児島〜宇多津 | ||
| 九州旅客鉄道 | 鹿児島線 | 門司港〜八代 | |
| (門司〜折尾) | |||
| (東小倉〜小倉) | |||
| (博多〜竹下) | |||
| 木場茶屋〜串木野 | |||
| 東市来〜鹿児島 | |||
| 佐世保線 | 大町〜高橋 | ||
| 山陽線 | 下関〜門司 | 単線並列 | |
| 筑肥線 | 姪浜〜筑前前原 | ||
| 筑豊線 | 若松〜飯塚 | (中間〜鞍手 鉄橋改修工事により単線運転) | |
| 長崎線 | 鳥栖〜江北 | ||
| 諫早〜喜々津 | |||
| 浦上〜長崎 | |||
| 日豊線 | 小倉〜立石 | ||
| 中山香〜杵築 | |||
| 日出〜大分 | |||
| 九州新幹線 | 博多〜鹿児島中央 | ||
| 西九州新幹線 | 武雄温泉〜長崎 | ||
| 東日本旅客鉄道 | 越後線 | 新潟 | 停車場構内 |
| 西日本旅客鉄道 | 宇野線 | 大元 | 停車場構内 |
| 妹尾 | 停車場構内 | ||
| 伯備線 | 新見 | 停車場構内 | |
| 四国旅客鉄道 | 予讃線 | 市坪 | 停車場構内 |
| 東日本旅客鉄道 | 奥羽線 | 山形〜羽前千歳 | 単線並列 |
| 大曲〜神宮寺 | 単線並列 | ||
| 峰吉川〜秋田 | 単線並列 | ||
| 鶴見線 | 浜川崎〜扇町 | 単線並列 | |
| 四国旅客鉄道 | 高徳線 | 佐古〜徳島 | 単線並列 |
| (補 足) | |||
| 北海道旅客鉄道 | 函館線 | 桑園〜札幌 | 複線・単線並列 |
| 東日本旅客鉄道 | 鶴見線 | 浅野〜安善 | 複線・単線並列 |
| 西日本旅客鉄道 | 山陽線 | 兵庫〜鷹取 | 複々線・単線並列 |
| 九州旅客鉄道 | 鹿児島線 | 吉塚〜博多 | 複線・単線並列 |